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西湖大学医学院的郭天南教授及其合作者,通过对近 3000 份人体组织样本进行分析,这些样本涵盖了 58 种正常组织和 25 种癌症类型,并对超过 1.3 万种蛋白质进行了定量测定,成功构建了目前分辨率最高、覆盖最广的人体蛋白质空间分布图谱

这项研究的背景是,蛋白质作为生命活动的关键执行者和大部分药物的作用靶点,其在人体内的整体空间分布长期以来缺乏系统性的了解。郭天南团队开发了一种适用于微量样本的蛋白质组分析方法。该方法能够利用仅相当于芝麻大小的组织样本,完成标准化的蛋白质组学分析。

这种新方法不仅将分析效率提升了约十倍,还大幅降低了实验成本,为进行大规模、高通量的蛋白质组学研究提供了技术支持。研究人员持续收集样本并进行实验分析,最终建立了一个包含 15332 种蛋白质的数据库,并在此基础上对 13609 种蛋白质进行了精确的定量分析,从而绘制出了这份高精度的人体蛋白质组“地图”。

利用这张蛋白质“地图”,研究团队还对比了 25 种癌症中肿瘤组织与相邻正常组织的蛋白质表达差异,共发现了 8940 种表达水平不同的蛋白。分析结果表明,不同癌症类型的蛋白质变化幅度存在显著差异,其中结肠癌、直肠癌和睾丸癌的蛋白质变化尤为突出。

此外,该团队还鉴定出了 2879 种肿瘤特异性蛋白,这些蛋白仅在特定类型的癌症中表现出表达变化

这项研究成果已以“Spatial distribution of the proteome in the human body and in cancers”为题发表在《自然》杂志上。相关研究数据已通过公开数据库 db.prottalks.com 向全球研究人员开放,用户可以查询蛋白质在 58 种人体组织中的表达水平,并比较不同癌症中的蛋白质变化情况。